自1995年问世以来，微型微阵列分析已成为全球基因组学、蛋白质组学、药学和临床实验室的主流分析技术。最初的微阵列芯片是由斯坦福大学的帕特·布朗开发的，利用沉积在底物上的寡核苷酸探针来发现细胞的基因组组成。在最初的关注之后，这项技术迅速扩展到利用其他相关的探针(如DNA、RNA、多肽、碳水化合物)。
除了扩大分子探针的类型，该技术还增加了探针可以附着的基底类型。玻片、塑料/硅片、二氧化硅或聚苯乙烯珠现在可以用作构建微阵列的介质。
微阵列幻灯片(Arrayit Corp)。
微阵列设计与实验
通常，一个微阵列由一组给定探针的微米大小的点组成，这些点是按顺序批量“打印”出来的。这些斑点是单一的，已知的寡核苷酸，多肽或碳水化合物。它们被固定在一个表面上，通常是通过氢键。一旦附着，蛋白质、核酸或全细胞裂解液就会被标记(荧光团、金属或化学发光)，并与探针杂交。彻底清洗后，光学检查装订程度。
这种方法测量了杂交的程度，由此可以得出一些结论。研究人员利用这些数据来确定基因型、给定mRNA的丰度、蛋白质的存在和水平，甚至小分子亲和力。
微阵列有无数的应用。微阵列实验可以在短时间内产生大量的数据。事实上，微阵列分析的限速步骤现在已经变成了输入的处理。微阵列分析(与其他分析技术一样)产生的“大数据”是如此广泛，以至于生物信息学领域也随之发展。
最后，相对便宜的设备现在存在内部打印微阵列，打开了这种研究方法几乎所有的实验室。选择合适的材料用于你的微阵列分析应该仔细考虑。
选择介质:珠子、幻灯片还是芯片?
在选择用于微阵列分析的介质时，要考虑这些因素。实验室可以选择从制造商购买预先印制的微阵列芯片和珠子，或在实验室中打印基片。预先印制的产品是用一套已知的探针准备的，这些探针是专门为细胞、组织类型或细胞过程设计的。玻片通常用于内部打印，用户可以根据自己的需要选择一套独特的探针用于审讯。
微阵列分析(对照=红色)。
微阵列载玻片通常由极低折射率的玻璃制成，在洁净室中制造，以防止污染。应用特定的表面化学涂层载玻片。固定探针很容易使用负担得起的仪器。内部打印的明显好处是能够选择您自己的探针。预印的微阵列通常包含不适用于研究人员正在进行的研究的探针。
由于有限的制造能力和用于内部打印的技术类型，这些微阵列通常具有较低的杂交效率相比，从制造商获得。正在处理大量微阵列的实验室将从降低的实验室打印成本中获益，而那些进行低数量实验的实验室可能会发现购买预打印幻灯片更划算。
预先印制的微阵列通常被点在二氧化硅或塑料芯片上，或固定在珠子上。塑料和硅片传统上被用于构建微阵列。这些芯片得益于近零的反射和固有荧光，这些条件会产生背景噪声。此外，这些载玻片是大批量生产的，严格控制和测试数据质量和杂交性能。
微阵列打印针(Arrayit)。
以珠为基础的分析也得益于这种程度的控制。此外，它们可以在溶液中进行，避免了使用专门的杂交和洗涤设备处理易碎介质的需要。使用专门的多通道荧光仪器是珠基分析的主要缺点。此外，这种分析技术可以通过比较两个独立荧光团的比例来识别单个探针，但必须在最小波长下进行测量。尽管有这些缺点，许多实验室将选择购买效率更高的预配置芯片和珠子，不需要内部的微阵列打印机。
无论您是选择购买微阵列芯片或微珠，还是打印自己的微阵列，这些实验都让您有机会在短时间内收集大量数据。传统上，蛋白质组学和遗传学实验室需要一个一个地研究基因和蛋白质。微阵列的出现改变了这种动态，现在即使是最小的实验室也可以在一次实验中研究整个基因组或蛋白质组。
